(1)分两种情况:
B在原点左边,如图1:
B在原点右边,如图2:
(2)①当B在原点左边时(图1),
∵BE⊥AC
∴∠BEC=90°
∴∠BCE+∠B=90°
∵∠BCE+∠A=90°
∴∠B=∠A
又∵∠BOD=∠AOC=90°
AC=BD,
∴△BOD≌△AOC,
∴OB=OA,
∵A(0,6),
∴OA=6
∴OB=6,
∴B(-6,0);
②当B在原点右边时(图2),同理可证OB=OA=6,
∴B(6,0)
∴点B的坐标是(-6,0)或(6,0);
(2)①当B在原点左侧时,
由△BOD≌△AOC,
∴OD=OC=m,
∴S= ½×OB×OD=½×6×m=3m(0<m<6),
②当B在原点右侧时,同理可得S=3m,(m>6).