解题思路：根据全面调查与抽样调查的定义，总体是指考查的对象的全体，个体是总体中的每一个考查的对象，样本是总体中所抽取的一部分个体，对各小题分析后利用排除法求解．
A、调查方法是抽样调查，故本选项正确；
B、全市小学六年级学生的语文、数学、英语三科总成绩总体，故本选项错误；
C、参加考试的某个学生的语文、数学、英语三科的总成绩是个体，故本选项正确；
D、被抽到的1000名学生的语文、数学、英语三科总成绩是样本，故本选项正确．
故选B．
点评：
本题考点： 总体、个体、样本、样本容量；全面调查与抽样调查．
考点点评： 本题要分清具体问题中的总体、个体与样本，关键是明确考查的对象．总体、个体与样本的考查对象是相同的，所不同的是范围的大小．