1.生物工程(发酵工程方向)
培养目标：主要培养生物工程基本原理与运用,突出发祥工程与酶工程在轻工食品中的应用.从事生产加工和新产品开发的高等应用技术人才.
主要课程：有机化学、物理化学、化工原理、生物学、生物化学、微生物学、发酵工程、生物工程设备、生物工程下游技术（?）、现代食品发酵技术、生化工程、造酒工艺学等...
2.生物工程(生物制药方向)
培养目标：主要培养掌握生物工程基本原理与运用,着重发酵工程、酶工程原理和技术在生物制药领域中的应用.能从事产品生产、技术管理、产品开发的高等应用技术人才.
主要课程：有机化学、物理化学、化工原理、生物学、生物化学、微生物学、发酵工程、生物工程设备、生物制药工艺学、生物制药分析、药理学概论等...