解题思路：酵母菌属于真菌，是单细胞生物，整个身体由一个细胞构成．
细菌的基本结构包括：细胞壁、细胞膜、细胞质、遗传物质，有些细菌还有鞭毛、荚膜等特殊结构；真菌的基本结构包括：细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，酵母菌的结构包括：细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核．
生物进化的证据有化石证据、比较解剖学上的证据、胚胎学上的证据，化石是指保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹；
（1）酵母菌是一种单细胞生物，细菌通常是通过细胞分裂方式进行繁殖的，营养方式为异养，靠分解动植物的遗体等来维持生活，它们被称为生态系统中的分解者．
（2）由分析知道：酵母菌和细菌都有的细胞结构是细胞壁、细胞质和细胞膜．
（3）化石是由古代生物的遗体、遗物或生活痕迹等，由于某种原因被埋藏在地层中，经过漫长的年代和复杂的变化而形成的．并不是生物的遗体、遗物或生活痕迹就叫化石，研究发现，不同的地层中埋藏着不同类型的生物化石：埋藏于较浅地层中的化石与现代生物结构比较相似，埋藏于较深地层中的化石与现代生物结构差别较大，并且越是古老的地层中发掘的生物化石结构越简单、低等，水生生物的化石越多；越是晚期的地层中发掘的生物化石结构越复杂、高等，陆生生物化石越多．化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物的进化历程和进化趋势：由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的，因此化石是研究进化的主要证据．
故答案为：（1）单；分裂；分解者（2）细胞膜
（3）化石
点评：
本题考点： 真菌的形态结构、营养方式和生殖方式的特点．
考点点评： 解题的关键是知道细菌和真菌的结构以及生物的进化．