解题思路：生物多样性的直接价值是指对人类有食用、药用和工业原料等实用意义的，以及有旅游观赏、科学研究和文学艺术创作等非实用意义的价值．生物多样性的间接价值是指对生态系统起到重要调节作用的价值，如森林和草地对水土的保持作用，湿地在蓄洪防旱、调节气候等方面的作用．生物多样性的间接价值明显大于它的直接价值．
生态系统中的组成成分越多，营养结构就越复杂，生态系统的自动调节能力就越强，其抵抗力稳定性就越强，相反的其恢复力稳定性就越弱．
A．种群密度是种群最基本的数量特征，调查动物种群密度常用标记重捕法，故A错误；
B．群落演替过程中生物多样性逐渐增加，人类活动使得群落演替不同于自然演替的方向和速度进行，故B错误；
C．生物多样性比较高的生态系统相对稳定，体现了生物多样性的间接价值，故C错误；
D．生态系统稳态的基础是具有自我调节能力，其调节机制属于反馈调节，故D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 生态系统的稳定性；估算种群密度的方法；群落的演替．
考点点评： 本题考查种群、群落和生态系统等相关知识，意在考查学生的识记和理解能力，属于中档题．