解题思路：探究实验包括提出问题、作出假设、设计实验、实施实验、得出结论、表达交流等步骤，其中作出假设是对提出问题的回答．
（1）本探究实验的目的是“探究黑暗对西瓜种子的萌发是否有影响”，因此提出的问题应是：黑暗对西瓜种子的萌发有影响吗？
（2）作出假设是对提出问题的肯定或否定式回答，作出假设应是：黑暗对西瓜种子的萌发有（或没有）影响．
（3）A瓶与B瓶的惟一区别是遮光与见光，因此二者的变量是黑暗（或光）；设置B瓶的作用是与A瓶形成对照．
（4）由于处于遮光条件下的西瓜种子发芽，而见光的西瓜种子没有发芽；根据这一实验结果，得出的结论是：西瓜种子只有在黑暗条件下才能萌发．
故答案为：
（1）黑暗对西瓜种子的萌发有影响吗？
（2）黑暗对西瓜种子的萌发有（或没有）影响
（3）黑暗（或光）；对照
（4）西瓜种子只有在黑暗条件下才能萌发
点评：
本题考点： 探究种子萌发的条件．
考点点评： 探究实验探究哪种环境因素对生物的影响，这一环境因素就是实验的变量．