解题思路：阅读题干可知，该题的知识点是诱发基因突变的因素在基因突变中的作用，基因突变的特点，人类遗传病的类型，自然选择在生物进化过程中的作用，梳理相关知识点，然后分析选项进行解答．
A、基因突变不一定由物理、化学及病毒因素的诱导下发生，没有物理、化学及病毒因素的诱导，基因也可能发生突变，A正确；
B、发生在体细胞中的突变，往往不能通过有性生殖传递给后代，B错误；
C、人类遗传病有基因遗传病，也有由染色体变异引起的遗传病，C错误；
D、细菌的抗药性是由基因突变引起的，抗生素的使用对抗药性基因起了选择作用，加速了生物进化的过程，D错误．
故选：A．
点评：
本题考点： 诱发基因突变的因素；人类遗传病的类型及危害．
考点点评： 本题旨在考查学生理解所学知识的要点、把握知识点的内在联系并应用相关知识对某些生物学问题进行解释、推理、判断、获取结论的能力．