解题思路：本题是对现代生物进化理论内容的考查，梳理现代生物进化理论的主要内容，然后分析选项进行解答．
①自然选择使种群基因频率发生定向改变，从而使生物沿着一定的方向进化，①正确；
②生物进化的实质是种群基因频率的改变，②正确；
③种群是生物进化的单位，③错误；
④种群通过地理隔离可能会导致生殖隔离而产生新物种，④正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 现代生物进化理论的主要内容；基因频率的变化；物种的概念与形成．
考点点评： 本题的知识点是生物进化的实质，自然选择对种群基因频率变化的影响，生物进化的单位，隔离在物种形成过程中的作用，对于现代生物进化理论内容的理解是解题的关键．