区域化,即细胞的各种生物分子通常都限制在一定的区域内,如DNA只是存在于细胞核内,核糖体则留在细胞质内；不同的区域负责不同的功能,如细胞的能量代谢主要发生在线粒体内,蛋白质翻译则在细胞质内进行.此外,生物体常常通过生物分子在不同区域的移动来控制和实施其生命活动.例如,细胞色素C是存在于线粒体内的一种蛋白质.当细胞受到伤害时,细胞可以通过一系列调节细胞死亡的信号蛋白的相互作用,将细胞色素C释放到细胞质,从而启动执行细胞死亡的蛋白机器,最后导致细胞死亡.显然,生物网络的这种对时空的依赖性更导致了生物系统行为的复杂化.