解题思路：本题主要考查了现代生物进化理论的内容．
种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在这个过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
A、自然选择导致种群基因频率发生定向改变，A错误；
B、生物进化的实质是种群基因频率的改变，基因频率改变不一定产生新的物种，生殖隔离是新物种形成的必要条件，B错误；
C、地理隔离阻碍了基因交流，当种群基因库产生较大差别时，才会导致生殖隔离，如东北虎和华南虎存在地理隔离但还是同一种生物，C错误；
D、新物种产生量小于现有物种灭绝量会导致物种多样性降低，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 现代生物进化理论的主要内容．
考点点评： 本题主要考查了学生对基础知识的记忆和理解能力．在解题时要掌握知识的关键所在，比如要知道：生物进化的方向是由自然选择来决定的；生物进化的过程实质上是种群基因频率发生变化的过程；研究物种间的差异，关键是研究它们能否形成生殖隔离；研究物种的迁徙规律，应该以种群为单位，而不是以个体为单位．