tRNA呈三叶草结构.它由3个环,即D环〔因该处二氢尿苷酸（D）含量高〕、反密码环（该环中部为反密码子）和TΨC环〔因绝大多数tRNA在该处含胸苷酸（T）、假尿苷酸（Ψ）、胞苷酸（C）顺序〕,四个茎,即D茎（与D环联接的茎）、反密码茎（与反密码环联接）、TΨC茎（与 TΨC环联接）和氨基酸接受茎〔也叫CCA茎,因所有tRNA的分子末端均含胞苷酸（C）、胞苷酸（C）、腺苷酸（A）顺序,CCA是连接氨基酸所不可缺少的〕,以及位于反密码茎与TΨC茎之间的可变臂构成.
rRNA（核糖体RNA）：原核生物和真核生物的核糖体均由大、小两种亚基组成.rRNA是单链,它包含不等量的A与U、G与C,但是有广泛的双链区域.在双链区,碱基因氢键相连,表现为发夹式螺旋.
mRNA：从DNA转录合成的带有遗传信息的一类单链RNA,它在上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的排列顺序.原核生物mRNA一般5'端有一段不翻译区,称前导顺序,3'端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质.通常mRNA（单链）分子自身回折产生许多双链结构.
相同：都是由核糖,尿嘧啶,胞嘧啶,鸟嘌呤,腺嘌呤和磷酸组成.