解题思路：A、纯净物是由同种物质组成，只含一种分子；
B、单质是由同种元素组成的纯净物；
C、原子核内质子数一定等于电子数，但不一定等于中子数；
D、气体受压体积缩小是因为气体分子之间间隔发生改变．
A、纯净物是由同种物质组成，只含一种分子，故正确；
B、单质是由同种元素组成的纯净物，但由同种元素组成的物质可能是混合物，如O3和O2，故错误；
C、原子核内质子数一定等于电子数，但不一定等于中子数，故错误；
D、气体受压体积缩小是因为气体分子之间间隔发生改变，故错误．
故选A．
点评：
本题考点： 分子、原子、离子、元素与物质之间的关系；纯净物和混合物的判别；单质和化合物的判别；原子的定义与构成；利用分子与原子的性质分析和解决问题．
考点点评： 本题考查学生对原子的构成、性质及物质的分类知识的理解、掌握与应用的能力．