解题思路：解答本题需紧扣题干中的关键词，如“间作套种”、“农田退耕还草还林”等．另外生态农业中以及污水处理中利用了物质循环再生的原理．
（1）间作套种能够合理配置作物群体，使作物高矮成层，相间成行，有利于改善作物的通风透光条件，提高光能利用率，这样就使流经此生态系统的总能量增加，从而增加害虫的环境容纳量．
（2）农田退耕还草还林的过程中，农田生态系统首先演变为草原生态系统，再由草原生态系统演变为森林生态系统，该演变过程中物种数量越来越多．并且这种演替原来就有生物和较好的土壤条件，因此属于次生演替．
（3）水中有机物过多，就会导致水体中的好氧细菌增多，消耗氧气，导致水体中含氧量减少．由于分解者的分解作用，有机物被分解为无机物，导致下游水域中的N、P等无机养料大量增加，为藻类的繁殖提供了丰富的营养．
故答案为：（1）增加增加
（2）上升次生
（3）耗氧细菌大量繁殖，消耗氧气N、P等无机养料经过微生物的分解作用大量增加，为藻类的繁殖提供了丰富的营养．
点评：
本题考点： 生态农业工程．
考点点评： 本题考查了生态农业中的物质循环和能量流动、以及群落演替的相关知识，意在考查考生能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论的能力．