解题思路：等位基因是指位于同源染色体相同位置，控制相对性状的一对基因．图A和图B相比，可以看出染色体上基因的数目不变，只是基因的位置发生改变，属于染色体结构变异中的倒位．XXY为雌性可育、XYY为雄性可育、XO为雄性不育，由此看出，果蝇的性别取决于X染色体的数目．
（1）①图A中的朱红眼基因与深红眼基因是位于同一条染色体不同位置并且控制不同性状的基因，它们属于非等位基因．
②与图A相比，图B中上面四个基因所存在的染色体位置发生了颠倒，这种变异属于染色体结构变异中的倒位．
（2）①由上表可知，有两条X染色体的果蝇为雌性，只有一条X染色体的为雄性，因此果蝇的性别取决于X染色体的数目．
②由摩尔根杂交实验可得，红眼为显性性状，因此白眼雌果蝇的基因型为XbXb，红眼雄果蝇的基因型为XBY．根据以上表格可以判断，后代雌果蝇中出现一只白眼可育果蝇基因型为XbXbY，雄果蝇中的一只红眼不育果蝇基因型为XBO．XbXbY中的两条X染色体均来自于亲本中雌果蝇提供的卵细胞；XBO中，XB来自亲本果蝇中的红眼雄，则卵细胞中无X染色体，这两种情况都是该白眼雌果蝇在减数分裂过程中同源染色体未分裂或姐妹染色单体未分离的结果．
（3）①正常红眼雄果蝇（XBY）与白眼雌果蝇（XbXb）杂交，子代中出现一只白眼雌果蝇基因型可以表示为XbXb（雄果蝇在产生精子的过程中发生了基因突变）或XXb（即表示雄果蝇产生的精子中的X染色体上B基因缺失）．若该白眼雌果蝇（XXb）与红眼雄果蝇（XBY）杂交，由于此缺失发生在雄性的X染色体上也会致死，因此子代中雌果蝇数与雄果蝇数比为2：1．若白眼雌果蝇出现的原因是基因突变，则杂交子代中雌果蝇数与雄果蝇数比应为1：1．
②由于该白眼果蝇（XXb）的一条X染色体上片段的缺失，因此在减数分裂过程中，配对的染色体会出现凸环现象．染色体结构和数目的变异是可以在光学显微镜下观察到的．
故答案为：
（1）①非等位 ②染色体结构变异（倒位、染色体片段颠倒）
（2）①X ②白眼雌 同源染色体没有分离 XbXbY和XBO
（3）①1：1 X染色体缺失 ②不能配对的凸环 显微镜观察染色体
点评：
本题考点： 伴性遗传；染色体结构变异的基本类型．
考点点评： 本题考查了染色体变异以及伴性遗传的相关知识，意在考查考生能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论的能力．