most一词既可以作副词,意为“最多,最.”；又可以作名词,意为“大部分,大多数”；还可以作形容词,意为“大部分的,多数的；最多的”.如：
1.作副词：Your attitude to life is the most important thing in your life.
在你的生活中,你怎样看待生活是极其重要的.
2.作名词：Most of her life is spent teaching and helping the country children.
她一生的大部分时间都是在教育和帮助那些乡村孩子.
3.作形容词：
The finding was reported in most newspapers.
大多数报纸上报道了这个发现.
提问句的句子是对的,全句句意为：...因为,当时荷兰有最多的商船.句中the most 修饰merchant ships；而most of the merchant ships意为：大部分的商船,在此不符合句意.