核酸酶是用于降解核酸的.
作用于RNA的内切酶主要有：牛胰核糖核酸酶（RNase）核糖核酸酶T1（RNaseT1）
核糖核酸酶U2（RNaseU2） 多头绒孢菌核糖核酸酶1
作用于DNA的内切酶主要有：牛胰脱氧核糖核酸酶（DNaseI）牛脾脱氧核糖核酸酶 （DNaseII）
另外存在一些限制性内切酶（来自于细菌,用于基因工程）.
同时作用于RNA和DNA的外切酶：牛脾磷酸二酯酶（SPDase) 蛇毒磷酸二酯酶（VPDase）
作用于核算分子末端单酯键的：磷酸单酯酶（PMase）
而DNA复制时引物合成的酶是引发酶,主要是一种聚合酶.原核生物大肠杆菌是一种RNA聚合酶.真核生物DNA聚合酶α（polα）可以合成引物.合成引物还有其他很多蛋白参与至少有6种.共同构成引发体（primosome）.