基因多态性 单倍型 平均核苷酸差异数

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  • 基因多态性位点数:是指所研究的基因序列在所有研究对象中的总的突变位点数.

    单倍型个数:所有被研究的对象中所含有的不同单倍型的数目.

    单倍型多样性:是指样本中随机抽取到两个不同单倍型的频率,单倍型多样性高的群体说明其遗传多样性高,遗传资源丰富.用统计学方法很好计算,比如说样本数为10,单倍型个数为10,则单倍型多样性为1;而单倍型个数为9时,则随机抽取到两个不同单倍型的频率为1-(2/10)*(1/9)=0.9778

    平均核苷酸变异数:所有个体的核苷酸变异数之和 / 个体数

    样本数为10,总突变核苷酸数位666,则平均平均核苷酸变异数

    为66.6

    核苷酸多样性:平均核苷酸变异数 / 基因序列长度

    基因序列长度为1000,则核苷酸多样性为66.6/1000=0.0666