解题思路：根据“杂合子的黑毛豚鼠”可知黑毛相对于白色是显性性状（用A表示），则亲本的基因型均为Aa，根据基因分离定律，杂合子的黑毛豚鼠交配，即Aa×Aa→AA（黑）：Aa（黑）：aa（白）=1：2：1，所以黑色占[3/4]，白色占[1/4]．
A、在子代数目较少的情况下，不一定会出现3：1的分离比，子代有可能是全部黑色或全部白色或其他的情况，故A错误；
B、在子代数目较少的情况下，不一定会出现3：1的分离比，子代有可能三黑一白或一黑三白或其他比例，故B错误；
C、在子代数目较少的情况下，不一定会出现3：1的分离比，子代有可能二黑二白或其他比例，故C错误；
D、在子代数目较少的情况下，可能存在偶然性，后代不一定会出现3：1的分离比，有可能是全部黑色或全部白色或三黑一白或一黑三白或二黑二白，故D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因分离定律及应用，意在考查考生能理解所学知识要点，把握知识间内在联系的能力；能运用所学知识与观点，通过比较、分析与综合等方法对某些生物学问题进行解释、推理，做出合理的判断或得出正确的结论．