一般生物脱氮是指 硝化和反硝化 .硝化是指把铵盐等转化为亚硝酸盐在转化为硝酸盐.反硝化是把硝酸盐转化为氮气即实现脱氮.其中硝化是自养菌利用CO2作为碳源,反硝化是异养菌需要消耗水体中有机物且在缺氧（有较多硝酸盐）的环境中才能进行（有硝酸盐所以呈现缺氧）,
所以把缺氧池放在好氧池前面是为了反硝化菌有足够的有机物作为碳源进行反硝化实现脱氮,好氧池再回流一部分至缺氧池,进行反硝化.
如果放置好氧池后面,好氧环境中其他微生物会消耗水体有机物,进入缺氧池后水体的有机物不足,难以实现充分脱氮.
另外保持厌氧环境是为了除磷,除磷是“厌氧释磷,好氧吸磷".厌氧必须是严格厌氧
（无氧气和硝酸盐）,硝酸盐大量存在是缺氧.厌氧+缺氧+好氧是为了脱氮除磷双重功能.