解题思路：构成蛋白质的基本单位是氨基酸，其结构特点是每种氨基酸分子至少都含有一个氨基和一个羧基，并且都有一个氨基和一个羧基连接在同一个碳原子上，这个碳原子还连接一个氢原子和一个侧链基团．
氨基酸在核糖体上通过脱水缩合的方式形成多肽，连接两个氨基酸分子的化学键叫做肽键，用化学式-NH-CO-表示．
在蛋白质分子合成过程中①失去水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数；②蛋白质相对分子质量=氨基酸平均相对分子质量×氨基酸数量-失去水分子数×水的相对分子质量③一个肽链中至少有一个游离的氨基和一个游离的羧基，在肽链内部的R基中可能也有氨基和羧基．
根据多肽链的形成过程可知：在形成该蛋白质分子时脱去的水分子总相对分子质量为1620，说明生成的水分子为1620÷18=90．根据失去水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数，设肽链数为X，则氨基酸数=肽键数+肽链数．根据蛋白质相对分子质量=氨基酸平均相对分子质量×氨基酸数量-失去水分子数×水的相对分子质量可得：10412=128×（90+X）-1620，即可求出X=4．
故选：D．
点评：
本题考点： 蛋白质的合成——氨基酸脱水缩合．
考点点评： 本题考查了蛋白质合成过程中的相关计算，意在考查学生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，能用数学方式准确地描述生物学方面的内容、以及数据处理能力．