首先启动 RNA聚合酶正确识别DNA模板上的启动子并形成由酶、DNA和核苷三磷酸(NTP)构成的三元起始复合物,转录即自此开始.DNA模板上的启动区域常含有TATAATG顺序,称普里布诺盒或P盒.复合物中的核苷三磷酸一般为GTP,少数为ATP,因而原始转录产物的5′端通常为三磷酸鸟苷(pppG)或腺苷三磷酸(pppA).真核 DNA上的转录启动区域也有类似原核DNA的启动区结构,和在-30bp（即在酶和 DNA结合点的上游30核苷酸处,常以—30表示,bp为碱基对的简写）附近也含有TATA结构,称霍格内斯(Hogness)盒或 TATA盒.第一个核苷三磷酸与第二个核苷三磷酸缩合生成3′-5′磷酸二酯键后,则启动阶段结束,进入延伸阶段.