解题思路：本题主要考查了生物的分类、不同生物在结构和功能上的区别．
1、生物可分为病毒、原核生物和真核生物．病毒是非细胞生物，原核生物由原核细胞构成，真核生物由真核细胞构成．病毒主要由蛋白质和一种核酸组成．原核生物的代表生物有细菌、蓝藻等．真核生物包括真菌、动物和植物，其中真菌包括酵母菌、霉菌和食用菌．
2、细菌、酵母菌和植物都具有细胞壁．动物没有细胞壁．
3、能将无机物合成有机物的生物为自养生物，主要包括能进行光合作用的生物和化能合成作用的生物．只能利用现成有机物的生物为异养生物，主要包括大多数动物、寄生生物和腐生的细菌、真菌等．绝大多数生物都能进行有氧呼吸．
A、①酵母菌为真菌的一种，属于真核生物，遗传物质是DNA；②乳酸菌为细菌的一种，属于原核生物，遗传物质是DNA；⑥烟草花叶病毒是非细胞生物，既不是原核生物也不是真核生物，属于RNA病毒，遗传物质是RNA．遗传物质可复制，故有可能发生基因突变，A错误；
B、①酵母菌、②乳酸菌和③硝化细菌都不能进行光合作用，故都不含叶绿素．①酵母菌和②乳酸菌都是腐生生物，属于分解者；③硝化细菌能进行化能合成作用，属于生产者，B错误；
C、①酵母菌和③硝化细菌都能进行有氧呼吸．①酵母菌只能利用现成有机物，为异养生物；③硝化细菌能进行化能合成作用，为自养生物，C错误；
D、③硝化细菌是细菌，④衣藻和⑤金鱼藻是植物，都具有细胞结构，且都有细胞壁，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题考查学生对原核生物和真核生物结构和功能方面的辨析能力，要求学生对这方面的知识有一个系统的了解．需要注意的是，包括病毒在内的一切生物遗传物质都能复制，都能发生基因突变；染色体变异只能发生在真核细胞中；基因重组只能发生在真核生物减数分裂的过程中．酵母菌的异化作用类型很特殊，它既能进行有氧呼吸，又能进行无氧呼吸；乳酸菌只能进行无氧呼吸，这个要对比记忆，易错．细菌、酵母菌和植物虽然都有细胞壁，但它们三者细胞壁的组成成分各不相同：细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖；酵母菌细胞壁主要由D-葡聚糖和D-甘露聚糖两类多糖组成组成，植物细胞壁主要由纤维素和果胶组成．