解题思路：健那绿染液是专一性染活细胞线粒体的染料；用甲基绿和吡罗红的混合染液染细胞，观察DNA、RNA的分布，此实验中还用到了盐酸，其作用是使DNA和蛋白质分离，便于染色．
A、健那绿染液是专一性染活细胞线粒体的染料，使线粒体呈现蓝绿色，不会使细胞死亡，不能固定细胞，A错误；
B、观察DNA、RNA的分布的实验中，用甲基绿和吡罗红的混合染液染细胞，B错误；
C、用取样器取样法调査小动物丰富度时，可以利用目测估计法进行统计，C正确；
D、观察植物细胞有丝分裂实验中，盐酸的作用是使组织中的细胞相互分离开来，同时杀死细胞，固定细胞形态，观察DNA、RNA的分布的实验中盐酸的作用是使DNA和蛋白质分离，便于染色，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 观察线粒体和叶绿体；DNA、RNA在细胞中的分布实验；观察细胞的有丝分裂；土壤中动物类群丰富度的研究．
考点点评： 此题考查实验中试剂的选择以及作用等相关知识，虽然繁琐，但是不难．