其“艰巨”表现在采用了涸泽而渔的思路,利用高通量,高性能的仪器设备,消耗大量的人力物力,而不是传统的一个基因或一个蛋白式的研究方式,因而不论是实验生物学的操作,还是生物信息学科研人员后续的实验数据整合分析,都能体现工作的“艰巨”；而其“复杂”则可以从和基因组的比较中窥其一斑,相对而言,基因组是静态的,而蛋白质组是动态变化的,尤其在不同的发育阶段和不同的生理病理状态下,都有所差别,这使得分析变得很“复杂”；不过这也同时给蛋白质组学研究带来很多有趣的“话题”；总之,生命活动的功能执行者是蛋白质,所以做蛋白质组学研究是大势所趋,也必将真正成为基因组计划后的收获时代.
为什么说蛋白质组学研究是更艰巨更复杂具有重要意义的阶段