解题思路：1、生物进化的证据有化石证据、比较解剖学上的证据、胚胎学上的证据，化石是指保存在岩层中的古生物遗物和生活遗迹．
2、遗传和变异是生物进化的内在基础，环境的变化是生物进化的外在动力，生物只有适应不断变化的环境，才能生存和发展．
A、研究发现，不同的地层中埋藏着不同类型的生物化石：埋藏于较浅地层中的化石与现代生物结构比较相似，埋藏于较深地层中的化石与现代生物结构差别较大，并且越是古老的地层中发掘的生物化石结构越简单、低等，水生生物的化石越多；越是晚期的地层中发掘的生物化石结构越复杂、高等，陆生生物化石越多．因此在研究生物进化的过程中，化石是非常重要的证据的说法正确．A正确．
B、化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物的进化历程和进化趋势：由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的．B正确．
C、达尔文指出，自然界中各种生物普遍具有很强的繁殖能力，从而能产生大量的后代．而生物赖以生存的食物和空间都是非常有限的，任何生物要生存下去就得为获取足够的食物和空间而进行生存斗争即生存竞争．C正确．
D、自然界中生物个体都有遗传和变异的特性，只有那些具有有利变异的个体，在生存斗争中才容易生存下来，并将这些变异遗传给下一代，而具有不利变异的个体被淘汰．自然界中的生物，通过激烈的生存斗争，适应者生存，不适应者被淘汰掉，这就是自然选择．生物通过遗传、变异和自然选择，不断进化．D错误．
故选：D
点评：
本题考点： 达尔文和自然选择学说．
考点点评： 遗传和变异是生物进化的内在基础，环境的变化是生物进化的外在动力，生物只有适应不断变化的环境，才能生存和发展．生物界普遍存在变异．