生物体内的有机物在细胞内的线粒体上经过一系列的氧化分解，最终生成二氧化碳和水，并且释放出能量的过程，叫做呼吸作用．
（1）若将点燃的蜡烛伸入甲瓶，蜡烛立刻熄灭，原因是萌发的种子吸收了瓶中的氧气；点燃的蜡烛在乙瓶中能继续燃烧，原因是乙瓶装有等量煮熟的种子，煮熟的种子没有生命现象，种子没有进行呼吸作用，瓶中还有氧气供蜡烛燃烧．
（2）若将甲、乙瓶分别按丙图装置进行实验，则看到甲瓶排出的气体能使石灰水明显变浑浊，这是因为萌发的种子进行呼吸作用放出了二氧化碳，而二氧化碳可以使澄清的石灰水变浑浊．
（3）实验中设置乙瓶的目的是与甲起对照作用．甲乙两组实验的变量是种子是否有生命，因此可以用来探究种子的呼吸作用．
（4）甲瓶内种子萌发过程中，能进行呼吸作用，分解种子内的有机物，释放出能量，供种子生命活动利用，所以有机物的重量会变少．
故答案为：
（1）氧气；乙瓶中煮熟的种子没有进行呼吸作用，瓶中还有氧气供蜡烛燃烧；
（2）甲；二氧化碳；
（3）与甲起对照作用；
（4）少．