解题思路：由题意知，该种群基因频率改变是由于自然选择作用，如果变化的环境对于A有利，增基因型为AA、Aa个体的生存能力强，基因型频率逐渐升高，A基因频率逐渐升高，a基因频率逐渐降低，图中乙曲线表示自然选择对A有利时A的基因频率的变化趋势；如果自然选择对a有利，则aa个体生存能力强，AA和Aa生存能力降低，因此a基因频率升高，A基因频率下降，图中甲曲线表示自然选择对a有利时a的基因频率变化趋势．
A、新物种形成的标志是产生生殖隔离，种群的基因频率发生改变不一定形成新物种，A错误；
B、种群基因型频率改变，不一定引起种群基因频率的改变，如杂合子自交，基因型频率变化，但是基因频率不变化，B错误；
C、图中甲、乙曲线变化幅度不同主要取决于变化的环境对具有不同性状的个体的选择作用，C错误；
D、当自然选择对隐性基因不利时，aa个体的生存能力低，AA、Aa生存能力高，A基因频率增加的速率较慢，因此乙曲线可以表示当自然选择对隐性基因不利时显性基因频率变化曲线，D正确．
故选：D．
点评：
本题考点： 基因频率的变化．
考点点评： 对于现代生物进化理论内容的理解，并应用相关知识结合题图曲线对某些生物学问题进行解释、推理、判断的能力是解题的关键．