解题思路：阅读题干可知，本题是生态系统的结构和功能的题目，根据选项涉及的具体内容梳理相关知识点分析判断．
A、寄生生物的存在会影响被寄生生物的生存，但不影响生物多样性．所以A错误．
B、由于能量流动是单向的，食物链的每一个环节都会产生大量的热量不能应用于生物自身有机物的合成．所以B错误．
C、变异是不定向的，生长于下层的植物为喜阴植物是长期自然选择的结果．所以C错误．
D、生态系统的负反馈调节既发生在生物之间，也发生在生物与无机环境之间．所以D正确．
故应选D．
点评：
本题考点： 物质循环和能量流动的基本规律及其应用；群落的结构特征；生态系统的结构．
考点点评： 本题的知识点是生物多样性，生态系统能量流动的特点，群里的结构，生态系统的反馈调节，主要考查学生对所学知识点的综合运用能力．