说实话,一般情况都是凭记忆,例如你这个quake,当按照音标一听到这个单词后,我就知道是quake,因为我的单词库中,就知道这么一个单词这么念（我翻了一下字典,也确实就这么一个单词这么念）.
同样对于你的问题,例如你听到的是cake的音标/keik/,你凭记忆就能写出cake.我明白你的意思,就是说,万一有别的单词叫/keik/怎么办?
对于单音节词,你肯定知道对于这种后面接一个不发音的e的情况,叫做相对开音节,一般a,e,i,o,u发字母本音,另一种叫绝对开音节,就是一个辅音,加一个元音,而且这个音节还是重读音节.例如,no,she,he这样.所以尊重这个规律,当你看到一个音标,例如/keik/,你应该首先想到这是a发它字母本身的音,然后它后面还有个辅音,所以这样的单词只能是相对开音节的单词,你就知道要加个e了.
对于多音节词,因为不像单音节那样全是重读音节,重读音节之外的音节都是非重读音节,a,e,i,o,u这样的元音字母的发音一般都不是发字母的本音,一般也涉及不到加不加e的问题.
当然,这只能说是一般规律,我还没有彻底考证,但我觉得也差不多.欢迎继续交流.