解题思路：可得数列的首项，进而可得a3，可得所求即为-46为首项，3为公差等差数列的前33项和，代入公式计算可得．
由题意可得a1+a2+a3+…+a98+a99=99a1+
99×98
2×1=99，
解之可得a1=-48，故可得a3=-48+2×1=-46，
故a3+a6+…+a96+a99表示以-46为首项，3为公差等差数列的前33项和，
故原式=33×（-46）+
33×32
2×3=66
故选D
点评：
本题考点： 等差数列的前n项和．
考点点评： 本题考查等差数列的求和公式，得出所求即为-46为首项，3为公差等差数列的前33项和是解决问题的关键，属基础题．