根据题意:
A、39000名学生的视力情况是总体,故本选项错误;
B、每名学生的视力是总体的一个个体,故本选项错误;
C、2000名学生的视力是总体的一个样本,故本选项正确;
D、上述调查是抽样调查,故本选项错误.
故选C.