A：其速度方向恰好改变了90°，可以判断恒力方向应为右下方，与初速度的方向夹角要大于90°小于180°才能出现末速度与初速度垂直的情况，因此恒力先做负功，当达到速度与恒力方向垂直后，恒力做正功，但是不知道恒力的具体方向，不能比较负功多还是正功多，所以不能判断两个速度谁大谁小．故A错误．
B：其速度方向恰好改变了90°，可以判断恒力方向应为右下方，与初速度的方向夹角要大于90°小于180°才能出现末速度与初速度垂直的情况，因此恒力先做负功，当达到速度与恒力方向垂直后，恒力做正功，因为不知道恒力的具体方向，不能比较负功多还是正功多，所以不能判断两个速度谁大谁小．故B错误．
C：虽然不能比较负功多还是正功多，但是可以判断出先做负功再做正功，所以速率先减小后增大．故C错误．
D：虽然不能比较负功多还是正功多，但是可以判断出先做负功再做正功，所以速率先减小后增大．故D正确．
故选：D