鱼体内代谢产物的排泄由肾和鳃来完成.泌尿器官是肾脏,鱼类的肾脏是1条长的紫红色条状物,位于腹腔的背部,属于中肾,在排泄废物方面,中肾的主要功能就是形成尿液.血液中溶解的代谢产物、水和营养物质等,经过肾脏内肾小球过滤,其中的水分和营养物质（如葡萄糖、氨基酸,以及钠、钙、镁、氯等离子）大部分回到血液中去,剩下的滤液和多余的有害物质形成尿液,由输尿管排除体外.除肾以外,鳃也进行氮化物和盐分的排泄,如排泄氨和尿素.实验证明,鲤鱼和金鱼由鳃排泄的含氮物质是肾排氮物的5～9倍.鱼类的肾脏除有泌尿功能外,还能调节体内水盐的渗透,因为鱼类生存在淡水和海水中,外环境与体内组织液和血液通常不是等渗的.海水中盐浓度高达3％以上,淡水中盐分浓度在0．3％以下,鱼类在这样的环境中生活,就有可能造成脱水或吸水.但是,事实并非如此,鱼类仍能终生在这样的水中生活,主要是依靠肾赃的调节,以及鳃部一些特殊细胞来进行补偿和调节.淡水鱼类有由数目众多的大型肾小体和肾小球组成的肾脏,当它们的体液和血液的浓度高于水环境时,肾脏能不断地排出尿液（体内过多的水分）,与此同时,鳃部的吸盐细胞又向血液中补充盐分,以保持淡水鱼类水盐平衡.海水鱼类与此相反,由于血液和体液中的盐分浓度大大低于海水浓度,就存在着体内水分不断向体外渗透的趋势,为适应环境,海产硬骨鱼类大量吞饮海水,被吞入的海水中所含大量的盐分由鳃部的一些泌盐细胞排出体外.同时,为防止体内失水,海产鱼类的肾小球多退化或完全消失.使排出与体液等渗的尿量减少.从而,以这几种方式来调节和保持体内的水盐平衡.