根据厌氧四阶段来解释
（1）第一阶段:水解、发酵阶段（发酵性细菌）
由厌氧或兼性厌氧发酵性细菌起主要作用.主要功能有两种：（1）水解-在胞外酶的作用下将不溶性有机物水解成可溶性有机物；（2）酸化-将可溶性大分子有机物转化成脂肪酸、醇类等.
这些细菌的水解过程较缓慢,并受多种因素（pH、SRT、有机物种类等）影响,有时会成为厌氧反应的限速步骤.
(2)第二阶段:产氢产乙酸阶段阶段（产氢产乙酸菌）
厌氧或兼性厌氧产氢产乙酸细菌在厌氧消化中的生理功能是将第一阶段的发酵产物如高级脂肪酸和醇类等氧化分解成乙酸、 H2和CO2 ,为产甲烷菌提供合适的基质.
主要的反应过程如下：
CH3CH2COOH +2H2O→CH3COOH+CO2+3H2
CH3CH2OH+H2O→CH3COOH+2H2
(3)第三阶段:耗氢产乙酸阶段阶段（同型产乙酸菌）
同型产乙酸菌,它们既能利用H2、CO2生成乙酸,也能代谢糖类生成乙酸.
2CO2+4H2→CH3COOH+2H2O
C6H12O6→3CH3COOH
（4）第四阶段:产甲烷阶段（耗乙酸产甲烷菌、耗氢产甲烷菌）
由严格厌氧的产甲烷菌群来完成,其主要功能是将产乙酸菌的产物乙酸、甲醇、甲胺、H2/CO2等转化为CH4和CO2 .
生成CH4的主要反应如下：
CH3COOH→CH4+CO2
CH3COONH4+H2O→CH4+NH4HCO3
4H2+CO2→CH4+2H2O
4HCOOH→CH4+3CO2+2H2O
4CH3OH→3CH4+CO2+2H2O
在此过程中,可降解的有机物逐渐被厌氧菌群分解利用,产生沼气,有机氮被分解形成氨氮,有机分解形成磷酸盐,导致厌氧消化液的高氨氮高磷特性.