1．愈伤组织受体系统：
受伤的细胞容易受到病毒或质粒的感染.这些病毒或质粒上的某些DNA通过各种不同的方式转移到受伤的植物细胞,并形成愈伤组织.愈伤组织可以培养成完整的转化植株.该受体系统转化率高,可获得较多的转化植株,取材广泛、适用性广.但再生植株无性系变异较大,转化的外源基因稳定性差,嵌合体多.
2．原生质体受体系统：
是植物细胞除去细胞壁后的部分,是一个质膜包围的“裸露细胞”.原生质体在合适的条件下具有分化、繁殖并再生成完整植株的能力,具有全能性.原生质体在体外比较容易完成一系列细胞操作或遗传操作,互相之间可以发生细胞融合,而且还可以直接高效的捕获外源基因,嵌合体少.但缺点是遗传稳定性差,培养周期长,难度大,再生频率低.
3．生殖细胞受体系统：
它是以植物生殖细胞如花粉细胞、卵细胞为受体细胞进行基因转化的系统.目前主要以两条途径利用生殖细胞进行基因转化：一是利用组织培养技术进行花粉细胞和卵细胞的单倍体培养,诱导愈伤组织细胞,进一步分化发育成单倍体植株,从而建立单倍体的基因转化系统；二是直接利用花粉和卵细胞受精过程进行基因转化,如花粉管导入法、花粉粒浸泡法、子房微针注射法等.由于该受体系统与其它受体系统相比有许多优点,如：具有全能性的生殖细胞直接为受体细胞,具有更强的接受外源DNA的潜能,一旦将外源基因导入这些细胞,犹如正常的受精过程会收到“一劳永逸”的效果；利用植物自身的受粉过程,具有操作方法方便、简单.不足之处是利用该受体系统进行转化受到季节的限制；只能在短暂的开花期进行,且无性繁殖的植物不能采用.
4.叶绿体转化系统
外源基因可以在叶绿体中得到稳定表达,而且还具有许多优点：
（1）便于外源基因定位整合
（2）基因为多拷贝,表达量高
（3）导入的外源基因性状稳定性高
（4）能直接表达原核基因