解题思路：1、原核细胞与真核细胞相比，最大的区别是原核细胞没有被核膜包被的成形的细胞核，没有核膜、核仁和染色体；原核细胞只有核糖体一种细胞器，但原核生物含有细胞膜、细胞质等结构，也含有核酸和蛋白质等物质．
2、生态系统的组成成分：
（1）非生物的物质和能量（无机环境）；
（2）生产者：主要是绿色植物，还有少数化能合成型生物；
（3）消费者：主要是动物，还有营寄生生活的微生物；
（4）分解者：主要是指营腐生生活细菌和真菌，还有少数动物．
A、酵母菌是一种真菌，属于真核生物，其代谢类型为异养型，属于分解者，它有细胞核，可产生染色体变异，A正确；
B、硝化细菌为自养型生物，属于生产者，其无染色体，不能发生染色体变异，但其仍能产生可遗传变异--基因突变，B错误；
C、乳酸菌（乳酸杆菌）为异养型生物，属于分解者，它是厌氧型生物，在细胞质基质中产生乳酸，C正确；
D、S型肺炎双球菌是一种寄生细菌，为异养型生物，属于消费者，它有荚膜，菌落光滑，有毒性，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 生态系统的结构；原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题考查生态系统的结构、原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同，要求考生识记一些常考生物的类别，掌握原核细胞和真核细胞形态和结构的异同；识记生态系统的组成成分及各成分的代谢类型，能结合所学的知识准确判断各选项．