解题思路：本题主要考查了现代生物进化理论的内容．
种群是生物进化的基本单位，生物进化的实质是种群基因频率的改变．突变和基因重组，自然选择及隔离是物种形成过程的三个基本环节，通过它们的综合作用，种群产生分化，最终导致新物种形成．在生物进化过程中，突变和基因重组产生生物进化的原材料，自然选择使种群的基因频率定向改变并决定生物进化的方向，隔离是新物种形成的必要条件．
性染色体组成为XYY个体是由正常卵子X与异常精子YY结合形成的．
A、金鱼不能与野生鲫鱼杂交，这说明金鱼与野生鲫鱼为不同的物种，它们之间存在生殖隔离，A正确；
B、众多金鱼品种都是经过人工培育、选择等过程形成的，有的没有经过地理隔离，B错误；
C、“蓝剑”的性染色体组成为XYY是由正常卵子X与异常精子YY结合形成的，产生的原因是亲本中雄性个体在减数第二次分裂时遗传物质分配异常所致，C正确；
D、“蓝剑”的性染色体组成为XYY，不能直接产生后代的根本原因是减数分裂形成配子的过程中性染色体联会紊乱，D正确．
故选：B．
点评：
本题考点： 生物进化与生物多样性的形成．
考点点评： 本题考查现代生物进化理论的主要内容，要求考生识记现代生物进化理论的主要内容，只要考生识记即可正确答题，属于考纲识记层次的考查