解题思路：等位基因一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因．在体细胞中，染色体成对，基因成对．成对的基因在成对的染色体上，染色体的位置相同．
A、A与a虽然在同一对染色体，但是位置不同，A错误；
B、A与a或B与b不在同一对染色体上，B错误；
C、A与a或B与b在同一对染色体上，而且位置相同，C正确；
D、A与a虽然在同一对染色体，但是位置不同，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 染色体、DNA和基因的关系．
考点点评： 解答此类题目的关键是知道等位基因位于同一对染色体而且位置相同．