A、由草甘膦的化学式可知，草甘膦是由碳、氢、氮、氧、磷5种元素组成的纯净物，属于化合物，故选项说法正确．
B、草甘膦是由草甘膦分子构成的，1个草甘膦分子是由3个碳原子、8个氢原子、1个氮原子、5个氧原子和1个磷原子构成的，1个草甘膦分子中含有18个原子，故选项说法错误．
C、草甘膦中碳原子的相对原子质量之和为12×3=36，氢原子的相对原子质量之和为1×8=8，氮原子的相对原子质量之和为14，氧原子的相对原子质量之和为16×5=80，；磷原子的相对原子质量之和为31，氢元素的相对原子质量之和最小，则氢元素的质量分数最小，故选项说法正确．
D、相对分子质量单位是“1”，不是“克”，常常省略不写，故选项说法错误．
故选BD．