（1）叶绿体中色素存在于类囊体膜上；与光合作用有关的酶分布在叶绿体的基粒和基质中．
（2）甲对应的时刻光照强度为0，此时不进行光合作用，知进行呼吸作用，甲在纵轴上对应的数值是呼吸作用强度，由于温度适当升高，呼吸酶活性增强，呼吸作用强度增大，因此甲点向下移动；乙点条件下，植物净光合作用为0，此时光合作用强度与呼吸作用强度相等；乙点进行光合作用，光反应在类囊体膜上进行，产生ATP，被叶绿体基质中的暗反应利用，因此叶绿体内ATP移动的方向是由类囊体薄膜移向叶绿体基质
．
（3）在图二甲状态时，细胞只进行呼吸作用，从外界吸收氧气，将二氧化碳释放到大气中，因此图一中发生的过程是：细胞从环境中吸收氧气（f），线粒体吸收氧气（g），线粒体释放二氧化碳（h），细胞释放二氧化碳（a）；图二中乙-丙段时，随光照强度增强，光合作用强度增大，说明该阶段限制光合作用的因素主要是光照强度．
（4）分析图一中可知，物质A是葡萄糖酵解的产物并进入线粒体中继续反应，因此为丙酮酸和[H]．
（5）在图二的丁点突然停止光照，光反应停止，不能产生[H]和ATP，三碳化合物还原受阻，而二氧化碳固定形成三碳化合物仍然进行，因此叶绿体内C3化合物的含量升高．
故答案为：
（1）类囊体膜上 叶绿体的基质和基粒中
（2）只进行呼吸作用向下移动 该光照强度下光合作用和呼吸作用强度相等
由类囊体薄膜向叶绿体基质
（3）f、g、h、a 光照强度
（4）丙酮酸和[H]
（5）升高