解题思路：1、基因重组：生物体进行有性生殖的过程中控制不同性状的基因的重新组合．
2、基因重组有自由组合和交叉互换两类．前者发生在减数第一次分裂的后期（非同源染色体的自由组合），后者发生在减数第一次分裂的四分体（同源染色体的非姐妹染色单体的交叉互换）．另外，外源基因的导入也会引起基因重组．
A、基因突变是生物变异的根本来源，A错误．
B、基因重组不能形成新基因，但能形成多种基因型，B正确；
D、基因重组发生在有性生殖过程，是一种可遗传变异，C正确；
D、非同源染色体上的非等位基因发生自由组合属于基因重组，D正确．
故选：A．
点评：
本题考点： 基因重组及其意义．
考点点评： 本题考查基因重组相关知识，意在考查学生理解基因重组的意义和基因重组的类型，属于中档题．