解题思路：分析图1：物质a～h依次是色素、O2、[H]、ATP、ADP、C3、C5、CO2．ATP的结构简式是A-P～P～P．
①是光反应过程，②是暗反应过程，③是有氧呼吸第一阶段，场所在细胞质基质；④是有氧呼吸第二阶段，场所在线粒体基质，能产生少量ATP；⑤是有氧呼吸第三阶段，场所在线粒体内膜，能产生大量ATP．
（1）①是光反应过程，能合成ATP，并将光能转化为ATP和[H]中活跃的化学能；②是暗反应过程，不能合成ATP，但要消耗ATP；③是有氧呼吸第一阶段，场所在细胞质基质，能产生少量ATP；④是有氧呼吸第二阶段，场所在线粒体基质，能产生少量ATP；⑤是有氧呼吸第三阶段，场所在线粒体内膜，能产生大量ATP．
（2）物质a～h依次是色素、O2、[H]、ATP、ADP、C3、C5、CO2．ATP的结构简式是A-P～P～P．
（3）将该植物从光照条件下突然移到黑暗处，即光照强度减弱，光反应减慢，为暗反应提供的〔H〕、ATP减少，进而影响暗反应过程中C3的还原，使C3的消耗量减少，而短时间内CO2 的固定不受影响，因此C3的含量升高．
（4）提取色素时，要加入石英砂、碳酸钙和无水乙醇，其中碳酸钙的作用是防止研磨中色素被破坏．根据色素的含量可知：甲是叶绿素b、乙是叶绿素a、丙是叶黄素、丁是胡萝卜素，其中胡萝卜素在层析液中的溶解度最大，其颜色是橙黄色．
故答案为：
（1）①③④⑤
（2）A-P～P～P CO2
（3）增加 ③
（4）防止色素被破坏 丁
点评：
本题考点： 光反应、暗反应过程的能量变化和物质变化；叶绿体色素的提取和分离实验；细胞呼吸的过程和意义．
考点点评： 本题考查光合作用的相关知识，意在考查考生的识记能力和识图能力；理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系的能力．