膜结合酶应该就是具有催化活性的跨膜蛋白质.这样的例子有很多,比如G蛋白、ATP酶等等.
如果你研究的是单一的酶催化体系,个人认为仅仅是膜破碎本身对酶活力的影响不大.但是这里有两个主要的问题.其一是如果你研究的是多酶复合催化的一系列反应（比如电子传递链）,那么膜的破碎就可能会造成传递链的中断.其二则是膜两侧的溶液区别是否需要维持.细胞本来用细胞膜包裹着自己最适的溶液体系.膜的破碎可能会造成酶最适pH、离子强度、底物浓度等各个因素的改变,从而无法得到真正的酶活.
至于为什么在测定酶活的时候需要将细胞进行破碎,我想无非原因有二.一是排除细胞在其中的影响.二则是大部分膜结合酶的催化活性中心都是在细胞膜内的.不打开膜你又怎么测酶活呢……