解题思路：由图可知牧草A随菌根接种，种群密度增加，所以其对菌根的依赖度高，实验区牧草接种菌根后，物种丰富度增大，所以生态系统营养结构变复杂，自我调节能力升高，抵抗力稳定性增加．
A、牧草采用样方法调查种群密度，为避免调查者主观因素的影响，要做到随机取样，且取各样方平均值，保证数据的科学有效性，A正确；
B、从图表中分析，优质牧草A在真菌作用下，种群密度逐年升高，而劣质牧草种群密度逐年降低，B正确；
C、接种真菌后，生态系统物种丰富度不断增加，物种多样性增强，生态系统营养结构复杂，自我调节能力增强，生态系统抵抗力稳定性提高，C正确；
D、菌根真菌从土壤吸收养分和水，同时有利于植物光合作用，植物为菌根真菌提供糖类等有机物，两者是互利共生关系，而不同牧草之间是竞争关系，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 种间关系；估算种群密度的方法；生态系统的稳定性．
考点点评： 本题考查调查种群密度的方法、生态系统的稳定性、种间关系等相关知识，意在考查学生的识图和判断能力，属于中档题．