解题思路：阅读题干可知本题涉及的知识点是噬菌体侵染实验、探究酵母菌呼吸方式、色素分离实验和探究基因与染色体关系，梳理相关知识点，根据选项描述结合基础知识做出判断．
A、用35S标记噬菌体的侵染实验中，蛋白质外壳吸附在细菌表面，如果搅拌不充分，则沉淀物中会存在少量放射性，A正确；
B、由于酒精溶液在加入酸性重铬酸钾溶液后能由橙黄色变为灰绿色，所以在“探究酵母菌的呼吸方式”实验中，酸性重铬酸钾溶液由橙黄色变为灰绿色说明酵母菌进行无氧呼吸产生了酒精，B正确；
C、由于叶绿素b在滤纸条上位于最下层，扩散速率最慢，说明叶绿素b在层析液中溶解度最低，C正确；
D、萨顿提出基因在染色体上是运用类比推理法，而摩尔根证明基因在染色体上是运用假说-演绎法，D错误．
故选：D．
点评：
本题考点： 噬菌体侵染细菌实验；叶绿体色素的提取和分离实验；探究酵母菌的呼吸方式．
考点点评： 本题综合考查噬菌体侵染实验、探究酵母菌呼吸方式、色素分离实验和探究基因与染色体关系的相关知识，意在考查学生理解所学知识的要点和综合运用所学知识分析问题的能力，具备对实验现象和结果进行解释、分析的能力．