解题思路：胚（胚芽、胚轴、胚根和子叶）是由受精卵发育而来的，其基因来自于父本和母本双方．胚豌豆中圆粒对皱粒为显性，基因型为Rr的圆粒豌豆植株自交所结种子中胚的基因型及比例为RR：Rr：rr=1：2：1，即后代中RR占[1/4]、Rr占[1/2]、rr占[1/4]．
四粒种子胚的基因型都相同的情况有三种：
（1）四粒种子的基因型均为RR，其概率为[1/4×
1
4×
1
4×
1
4＝
1
256]；
（2）四粒种子的基因型均为Rr，其概率为[1/2×
1
2×
1
2×
1
2＝
1
16]；
（3）四粒种子的基因型均为rr，其概率为[1/4×
1
4×
1
4×
1
4＝
1
256]．
因此四粒种子胚的基因型都相同的概率为[1/256+
1
16+
1
256＝
9
128]．
故选：D．
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查分离定律的实质及应用，要求考生掌握基因分离定律的实质，根据题干信息准确判断Rr自交后代的情况，明确四粒种子胚的基因型都相同的情况有三种，分别计算出每一种的概率再相加即可，注意准确计算，避免不必要的错误．