分子：组成物质化学性质的最小微粒.
原子：在化学反应中不可再分的微粒.
元素：是具有相同核电荷数（质子数）的同一类原子的总称.
分子是由原子组成的.分子,原子十九物质的围观状态来说的,元素是就物质的宏观状态来分析的.
比如臭氧跟氧气：保持臭氧化学性质的最小微粒是臭氧分子O3,而不是氧原子.同样保持氧气化学性质的最小微粒是氧气分子O2.氧原子决定不了物质,因为它可以不同的数目结合成不同的分子.稀有气体是单原子分子,所以其性质可由原子决定.
元素只能说某种物质是由什么什么元素组成的,元素没有数量的区分.