解题思路：所结无籽西瓜瓤的颜色和基因型是由母本决定的，与父本基因无关．
已知黄瓤的基因型是rr，所以发芽后用秋水仙素处理，得到四倍体西瓜植株的基因型是rrrr，以该四倍体植株作母本，二倍体纯合红瓤西瓜（RR）为父本进行杂交，获得三倍体植株，其基因型是Rrr．该植株由于3个染色体组无法正常分离，所以无法产生正常配子，因而形成了无子果实．果实是由母本的子房壁发育而来的，所以此植株所结无籽西瓜瓤基因型是Rrr，颜色是红瓤．
故选：B．
点评：
本题考点： 基因的分离规律的实质及应用．
考点点评： 本题考查基因的分离定律的实质及其应用等相关知识，意在考查学生对已学知识的理解程度、获取信息和判断后代基因型及比例的能力．