解题思路：芽孢杆菌是细菌，为原核生物，没有核膜包围的成形的细胞核，没有多种复杂的细胞器，只有核糖体一种细胞器．
解；A、黑藻俗称温丝草、灯笼薇、转转薇等，是真核生物，A错误；
B、草履虫是单细胞原生动物，为真核生物，B错误；
C、蓝藻属于原核生物界，是原核生物，与芽孢杆菌的结构相似，C正确；
D、艾滋病病毒没有细胞结构，D错误．
故选：C．
点评：
本题考点： 原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同．
考点点评： 本题考查原核细胞和真核细胞的形态和结构的异同的相关知识点，意在考查学生对所学知识的理解与掌握程度，培养了学生分析题意、获取信息和解决问题的能力．