解题思路：醋酸菌是异养好氧菌，制作果醋时要不断通入氧气．果胶酶并不特指某一种酶，而是分解果胶的一类酶的总称，包括多聚半乳糖醛酸酶、果胶分解酶和果胶酯酶等．健那绿是专门给线粒体染色的试剂．果胶酶能够分解果胶，瓦解植物的细胞壁及胞间层，使榨取果汁变得容易，也是果汁变得澄清．
A、醋酸菌是异养好氧菌，制作果醋时要不断通入氧气，同时该过程的酶的活性受温度的影响，A正确；
B、果胶酶并不特指某一种酶，而是分解果胶的一类酶的总称，包括多聚半乳糖醛酸酶、果胶分解酶和果胶酯酶等，B正确；
C、洋葱叶肉细胞是绿色的，健那绿染液将线粒体染成蓝绿色后无法被观察到．绿色会妨碍线粒体颜色的观察，C错误；
D、果胶酶能够分解果胶，瓦解植物的细胞壁及胞间层，使榨取果汁变得容易，也是果汁变得澄清，D正确．
故选：C．
点评：
本题考点： 观察线粒体和叶绿体；果胶酶的活性测定；酒酵母制酒及乙酸菌由酒制醋．
考点点评： 本题考查观察线粒体和叶绿体、果胶酶的活性测定、酒酵母制酒及乙酸菌由酒制醋的相关知识点，意在考查学生对所学知识的理解与掌握程度，培养了学生分析题意、获取信息和解决问题的能力．